Mikroskop nije otkrio jedan pojedinac, već je razvoj mikroskopije rezultat rada mnogih istraživača kroz vijekove. Međutim, holandski naučnik Antonie van Leeuwenhoek smatra se jednim od pionira u razvoju mikroskopa i mikroskopskih tehnika u 17. vijeku.
Van Leeuwenhoek je bio optičar i samouki mikroskopist koji je prvi put koristio jednostavni mikroskop kako bi proučavao različite uzorke pod povećanjem. Njegovi rani mikroskopi nisu bili složeni kao moderni mikroskopi, ali su omogućili proučavanje mikroskopskih detalja živih organizama poput bakterija, protozoa i drugih mikroorganizama.
Dakle, iako ne možemo govoriti o jednom „otkrivaču“ mikroskopa, Leeuwenhoek je bio ključna figura u ranom razvoju mikroskopije.